โรงเรียนกำเนิดวิทย์ได้จัดพิธีไหว้ครูปีการศึกษา 2559 ขึ้นซึ่งในปีนี้ตรงกับวันพฤหัสบดีที่ 2 มิถุนายน 2559 โดยมี ดร.ไพรินทร์ ชูโชติถาวร ประธานกรรมการบริหารโรงเรียนเป็นประธานในพิธี ผู้ร่วมพิธีมีทั้งคณะผู้ทรงคุณวุฒิ คณาจารย์ เจ้าหน้าที่ของโรงเรียน และนักเรียนโรงเรียนกำเนิดวิทย์รุ่นที่หนึง และสองมากันอย่างอุ่นหนาฝาคั่งทำให้พิธีดูมีมนต์ขลังและศักดิ์สิทธิ์

          ซึ่งพิธีไหว้ครูนั้นถือเป็นพิธีอันศักดิ์สิทธิ์ที่ประกิบขึ้นเพื่อให้ศิษย์ได้แสดงตนขอฝากเนื้อฝากตัวเป็นศิษย์กับครูบาอาจารย์ ซึ่งเป็นผู้ประสิทธิ์ประสาทวิชาความรู้ ศิลปวิทยาการ รวมทั้งคุณธรรม จริยธรรม หลักการดำรงชีวิต ดังเปรียบได้เป็นดั่งพระคุณที่สามของศิษย์

          และปีนี้ทางคณะกรรมการนักเรียนยังได้จัดธีมงานพิธีเป็นธีมของหวาน หรือ Dessert ในการจัดพานไหว้ครูอีกด้วย ซึ่งทำให้เกิดการแสดงออกซึ่งความคิดสร้างสรรค์ของนักเรียนที่ เน้นด้านวิทยาศาสตร์ที่ดีไม่น้อย พร้อมยังมีการรำอวยพร และการแสดงจากวงคอรัสของโรงเรียนอีกด้วย